Антитела контроля изотипа являются первичными антителами, которые не имеют специфичности к цели, но соответствуют классу и типу первичного антитела, используемого в приложении. Элементы управления изотипом используются в качестве отрицательных элементов управления, чтобы помочь дифференцировать неспецифический фоновый сигнал от сигнала специфического антитела. В зависимости от изотипа первичного антитела, используемого для обнаружения, и используемых типов клеток-мишеней, фоновый сигнал может представлять значительную проблему в различных экспериментах.
Причины фонового окрашивания, связанные с первичными антителами, включают (1) связывание с Fc-рецепторами на клетках-мишенях, (2) неспецифические взаимодействия антител с клеточными белками, углеводами и липидами и (3) клеточную аутофлуоресценцию.
Элементы контроля изотипа должны быть сопоставлены с основными видами и классом основных антител, включая легкие цепи (например, IgG2 Lambda, IgA1 Kappa). При использовании непосредственно меченных первичных антител важно использовать один и тот же конъюгат, чтобы избежать различий в обнаружении.
Хотя изотипные средства управления в основном используются в проточной цитометрии, их можно использовать в качестве стандартных блокирующих агентов и агентов для покрытия белков для других применений, включая иммунофлюоресценцию, иммуноцитохимия, вестерн-блоттинг и ИФА.